1874-1885 Kurator am Harvard Museum of Comparative Zoology, 1902 Direktor des Museums. Agassiz, Sohn des Louis Agassiz, unternahm zahlreiche Forschungsreisen, so nach den amerikanischen Pazifikküsten von Kalifornien bis zu den Galapagos-Inseln, in den Raum der Bahamas und Bermudas, zur Großen Barriere von Australien, trieb Tiefseeforschung im Golfstromgebiet, untersuchte die Meeresverhältnisse zwischen San Francisco und den Marquesas und bereiste schließlich die großen Seen in Afrika.

Hauptwerk: "Revision of the Echini" (2 Bände).